Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms