Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms