Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms