Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms