Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms