Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIN1Q9NXP7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms