Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms