Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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