Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIPK3Q9H422 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms