Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms