Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms