Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms