Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms