Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms