Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms