Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC9Q92623 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms