Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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