Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms