Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms