Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms