Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms