Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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