Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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