Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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