Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MELKQ14680 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MELKQ14680 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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