Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD4Q13485 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms