Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRJQ12913 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 767.9 ms