Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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