Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms