Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms