Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms