Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms