Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA4P54764 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA4P54764 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA4P54764 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms