Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms