Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms