Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms