Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms