Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms