Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms