Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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