Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms