Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms