Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB1P16220 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB1P16220 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms