Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PTPRCP08575 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRCP08575 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
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