Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms