Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms