Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms