Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms