Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHANK2Q9UPX8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms