Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms